全身治疗因病因尚不清楚，治疗效果不够理想。
1.免疫抑制剂目前认为本病与自身免疫性疾病有关，
近年来试用免疫抑制剂治疗，部分病例有一定效果。若能经检查确定为自身免疫性疾病，采用免疫抑制剂则有明显疗效。常用药物为肾上腺皮质激素泼尼松5mg/片，地塞米松0.75mg/片，一日3～4次，每次1片。5天后病情控制则减量，每日减5～10mg。总疗程为7～10天后停药，如疗程长，为防止感染扩散，应加用抗生素。对严重白塞综合征，可住院后给予氢化可的松100mg或地塞米松5mg和四环素1g加入5%～10%葡萄糖液中，静脉滴注，病情好转后逐步减量。对有胃溃疡糖尿病活动期肺结核的患者应禁用或慎用。
2.免疫调节剂和增加剂
左旋咪唑用于需增强细胞免疫作用者。成人一日3次，每次50mg，连服2日，停药5日，2～3月为一疗程。常见的副作用有头痛头错疲乏关节酸痛等，少数病例可发生粒细胞减少，在治疗过程中应定期作血常规检查。
丙种球蛋白适用于体液免疫功能减退者。在溃疡急性期时肌内注射1支，必要时1周后可再注射3ml。不宜长期使用，因使用过多反造成人体免疫反应的抑制称反馈抑制。
转移因子可将免疫功能转移给无免疫的机体，以恢复其免疫功能。适用于细胞免疫功能降低或缺陷者。1ml内含5×109白细胞提取物。注射于淋巴回流丰富的部位如腋下或腹股沟处之皮下。每次1ml，每周1～2次，10次为一疗程，一般用一疗程即可。
维生素维生素类药物可维持正常的代谢功能，促进病损愈合。在溃疡发作时给予维生素C0.1～0.2g，一日3次，复合维生素B每次1片，一日3次。
女性激素女性发病与月经周期有关者可慎用雌激素。已烯雌酚0.1mg，每晚服1次，自月经后5天起连
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