目前对咳嗽变异性哮喘的发病机理，大多数学者认为与典型的哮喘病的机制是一致的，是一种气道变应性炎症。仅仅是病程进展程度不同或气道炎症的严重程度不一而已。 一般对于小儿变异性咳嗽，我们可以采取以下的机制予以治疗和预防。
积极查找致敏原常见为吸入某些植物花粉屋尘螨真菌孢子动物皮屑食物中的鱼虾或接触油漆染料等。要仔细观察每次咳嗽发作前有什么因素存在，找出致敏因素，加以避免，防止再次接触。
避免诱因咳嗽变异性哮喘发作的诱因可有三种可能一是气候改变，冬春季为高发期，冷空气刺激为主要诱因，因而要作好保暖防护，特别是冬季清晨出门要穿暖和并戴上口罩;二是运动后咳嗽加重，因而有此类哮喘患儿要避免剧烈运动;三是情绪激动大哭大闹亦可诱发咳嗽发作，因而要尽量使患儿保持情绪稳定。
增强机体免疫功能咳嗽变异性哮喘实质是哮喘，而哮喘是变态反应性疾病，即因免疫功能异常而引起变态反应因此要注意改善和增强机体免疫功能。
治疗咳嗽变异性哮喘的原则与哮喘相同，因发病机制与哮喘病相同，都是存在气道慢性变态反应性炎症及气道高反应性的病理改变，所以，较长期地应用控制药物--吸入激素或白三烯受体拮抗剂，能取得较好疗效，疗程可较治疗哮喘时间短。虽然，白三烯受体拮抗剂的抗炎作用没有激素强，但对于不愿意应用吸入激素治疗或病情轻的患儿可推荐使用，现在白三烯受体拮抗剂已被用于2岁以上患儿。
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