皮下注射不好，皮内不容易注射，同时可引起过敏反应，肌肉途径最好，但新生儿上臂三角肌实际上没有什么肌肉，大腿上外侧肌肉是最佳注射点，臀部脂肪层厚不宜做为注射点，如果选用乙肝疫苗球蛋白为宜，可在一侧大腿打球蛋白，另一侧大腿打疫苗十分方便。
乙肝疫苗禁忌证对乙型肝炎疫苗最大的禁忌证是“过敏”，免疫后出现荨麻疹呼吸困难口和咽喉部水肿血压下降休克，严重者应用肾上腺素及时抢救，不要再接种。新生儿严重畸型，体重低于2.5kg，严重湿疹，发烧不可接种。
对疫苗的选择疫苗必需来自疾病预防控制中心，看准生产厂家生产批号生产日期失效日期疫苗外观略呈乳白，透明均匀无凝块无混浊，视为正品，否则禁用。
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